बिल्डिंग आर पैकेज: 'विषय'

Question

के लिए कोई वैश्विक कार्य परिभाषा नहीं है मैं पहली बार आर पैकेज बना रहा हूं और मुझे कुछ परेशानी हो रही है। मैं एक आरएमडी जांच कर रहा हूं और मुझे निम्न त्रुटि मिल रही है:

get.AlignedPositions: no visible global function definition for 'subject' 

मुझे यकीन नहीं है कि इसका क्या कारण है। मेरे पास मेरे कोड में "विषय" चर भी नहीं है। कोड काफी लंबा है इसलिए मैं इसे तब तक पेस्ट नहीं करता जब तक कि कोई टिप्पणी न करे। क्या मुझे कुछ विशिष्ट दिखना चाहिए?

alignment <-pairwiseAlignment(pattern = canonical.protein, subject=protein.extracted, patternQuality=patternQuality, 
          subjectQuality=subjectQuality,type = type, substitutionMatrix= substitutionMatrix, 
          fuzzyMatrix=fuzzyMatrix,gapOpening=gapOpening,gapExtension=gapExtension, 
          scoreOnly=scoreOnly) 

लेकिन विषय Biostrings पैकेज में pairwiseAlignment समारोह द्वारा परिभाषित किया गया है: केवल एक चीज मैं के बारे में सोच सकते हैं कि मैं इस तरह की एक पंक्ति है। आपके सहयोग के लिए धन्यवाद!

Answer 1

आर ने एक समारोह देखा, subject, subject नामक फ़ंक्शन के बिना उपयोग किया जा रहा है। इसके लिए एक संभावित कारण this discussion on R-devel में समझाया गया है। उस स्थिति में कोड सशर्त रूप से उपयोग किया जाता है, उदा। यदि कोई निश्चित पैकेज स्थापित है तो हम इसकी कार्यक्षमता का उपयोग करते हैं। उस सिस्टम पर पैकेज की जांच करते समय, जिसमें यह पैकेज स्थापित नहीं है, हम इन प्रकार की चेतावनियों में भाग लेते हैं। तो कृपया जांचें कि यह मामला हो सकता है या नहीं। वैकल्पिक रूप से, आपने विषय पर कॉल करके गलती की हो सकती है, जबकि कोई फ़ंक्शन मौजूद नहीं है, उदा। subject एक समारोह नहीं था बल्कि सिर्फ एक वस्तु थी।