एक 3 डी छवि (और resampling) का आकार बदलना

Question

मेरे पास एक मस्तिष्क की 3 डी छवि है (चलिए इसे फ्लैश कहते हैं) और वर्तमान में यह 263 x 256 x 185 है। मैं इसे किसी अन्य छवि का आकार बदलने के लिए आकार बदलना चाहता हूं (इसे पूरा_ब्रेन_ब्रावो कहते हैं) ; 256 x 256 x 176, और (उम्मीद है) अनुकरण करने के लिए एक लांज़ोस इंटरपोलेशन का उपयोग करें (Image.ANTIALIAS)। मेरा (असफल) प्रयास:

from scipy import ndimage as nd 
import nibabel as nib 
import numpy as np 



a = nib.load('flash.hdr') # nib is what I use to load the images 
b = nib.load('whole_brain_bravo.hdr') 

flash = a.get_data() # Access data as array (in this case memmap) 
whole = b.get_data() 

downed = nd.interpolation.zoom(flash, zoom=b.shape) # This obviously doesn't work 

क्या आपने कभी 3 डी छवि पर इस तरह की चीज की है?

Answer 1

scipy.ndimage.interpolate.zoom के लिए docstring से:

""" 
zoom : float or sequence, optional 
    The zoom factor along the axes. If a float, `zoom` is the same for each 
    axis. If a sequence, `zoom` should contain one value for each axis. 
""" 

दो छवियों के बीच पैमाने कारक क्या है? क्या यह सभी अक्षों में स्थिर है (यानी आप आइसोमेट्रिक स्केलिंग कर रहे हैं)? उस स्थिति में zoom एक एकल फ्लोट मान होना चाहिए। अन्यथा यह फ्लोट्स का एक अनुक्रम होना चाहिए, एक प्रति धुरी।

उदाहरण के लिए, whole और flash के भौतिक आयाम बराबर माना जा सकता है, तो आप कुछ इस तरह कर सकता है:

dsfactor = [w/float(f) for w,f in zip(whole.shape, flash.shape)] 
downed = nd.interpolation.zoom(flash, zoom=dsfactor) 

Answer 2

डॉक्स के अनुसार, zoom तर्क "है अक्ष के साथ ज़ूम कारक "। यह थोड़ा अस्पष्ट है, लेकिन ऐसा लगता है कि वांछित आयाम की बजाय उनका मतलब स्केल कारक है।

इस प्रयास करें:

zoomFactors = [bi/float(ai) for ai, bi in zip(a, b)] 
downed = nd.interpolation.zoom(flash, zoom=zoomFactors) 

एक फिल्टर चुनने के बारे में सुनिश्चित नहीं हैं - डॉक्स केवल विभिन्न आदेशों की पट्टी छेड़छाड़ का उल्लेख है।