2017-01-07 8 views
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मैं कुछ सटीक पूर्णांक मैट्रिक्स कंप्यूटेशंस के लिए java.math.BigInteger का उपयोग करने का प्रयास कर रहा हूं जिसमें स्केलर मान लाखों अंकों तक पहुंचते हैं। मैंने देखा है कि बिल्टइंटर ऑपरेशंस में से कुछ अप्रत्याशित रूप से बहुत धीमी हैं - विशेष रूप से जीसीडी के कुछ मामले, और modInverse के कई और मामले। ऐसा लगता है कि मैं इन कार्यों के अपने संस्करणों को कार्यान्वित कर सकता हूं जो बहुत तेज हैं।जावा के BigInteger जीसीडी और modInverse इतनी धीमी क्यों हैं?

मैं एक प्रोग्राम है जो एक लाख या तो करने के लिए एन अप के मूल्यों में वृद्धि के लिए gcd (10^एन -3, 10^एन) की गणना, या तो निर्मित gcd या अपने ही सरल विकल्प कार्यान्वयन का उपयोग के लिए समय प्रिंट लिखा था :

private static java.math.BigInteger myGcd(java.math.BigInteger a, java.math.BigInteger b) 
{ 
    a = a.abs(); 
    b = b.abs(); 
    while (true) 
    { 
     if (b.signum() == 0) return a; 
     a = a.mod(b); 
     if (a.signum() == 0) return b; 
     b = b.mod(a); 
    } 
} // myGcd 

मैं इसे ubuntu linux, क्रम संस्करण 1.8.0_111-8u111-b14-2ubuntu0.16.04.2-b14 के तहत जावा 8 का उपयोग कर भाग गया। जावा रनटाइम 1.8.0_92 के साथ मैकबुक पर समय लगभग अपेक्षाकृत समान हैं।

अंतर्निहित gcd मोटे तौर पर द्विघात है:

# numDigits seconds 
1 0.000005626 
2 0.000008172 
4 0.000002852 
8 0.000003097 
16 0.000019158 
32 0.000026365 
64 0.000058330 
128 0.000488692 
256 0.000148674 
512 0.007579581 
1024 0.001199623 
2048 0.001296036 
4096 0.021341193 
8192 0.024193484 
16384 0.093183709 
32768 0.233919912 
65536 1.165671857 
131072 4.169629967 
262144 16.280159394 
524288 67.685927438 
1048576 259.500887989 

खान लगभग रेखीय है (मामले में वर्णित के लिए; हाँ, मैं जानता हूँ कि यह सबसे खराब स्थिति में द्विघात हो गया है):

# numDigits seconds 
1 0.000002845 
2 0.000002667 
4 0.000001644 
8 0.000001743 
16 0.000032751 
32 0.000008616 
64 0.000014859 
128 0.000009440 
256 0.000011083 
512 0.000014031 
1024 0.000021142 
2048 0.000036936 
4096 0.000071258 
8192 0.000145553 
16384 0.000243337 
32768 0.000475620 
65536 0.000956935 
131072 0.002290251 
262144 0.003492482 
524288 0.009635206 
1048576 0.022034768 

सूचना कि, वर्णित मामले के दस लाख अंकों के लिए, बिल्टिन जीसीडी 10000 गुना अधिक समय लेता है जब तक मेरा: 25 9 सेकंड बनाम .0220 सेकेंड।

क्या अंतर्निहित जीसीडी फ़ंक्शन यूक्लिडियन एल्गोरिदम के अलावा कुछ और कर रहा है? क्यूं कर?

मुझे विस्तारित यूक्लिडियन एल्गोरिदम (यहां दिखाया नहीं गया) का उपयोग करके बिल्टिन modInverse बनाम अपने स्वयं के कार्यान्वयन के लिए समान समय मिलता है। बिल्टिन modcverse बिल्टिन जीसीडी करता है, उदा। जब एक छोटी संख्या 2,3,4 है, ... और बी बड़ा है।

यहाँ ऊपर डेटा के तीन भूखंडों हैं (दो अलग अलग रैखिक तराजू और फिर पैमाने लॉग इन करें):

/* 
    Benchmark builtin java.math.BigInteger.gcd vs. a simple alternative implementation. 
    To run: 
    javac BigIntegerBenchmarkGcd.java 
    java BigIntegerBenchmarkGcd mine > OUT.gcd.mine 
    java BigIntegerBenchmarkGcd theirs > OUT.gcd.theirs 

    gnuplot 
     set title "Timing gcd(a=10^n-3, b=10^n)" 
     set ylabel "Seconds" 
     set xlabel "Number of digits" 
     unset log 
     set yrange [0:.5] 
     #set terminal png size 512,384 enhanced font "Helvetica,10" 
     #set output 'OUT0.gcd.png' 
     plot [1:2**20] "OUT.gcd.theirs" with linespoints title "a.gcd(b)", "OUT.gcd.mine" with linespoints title "myGcd(a,b)" 
     #set output 'OUT1.gcd.png' 
     unset yrange; replot 
     #set output 'OUT2.gcd.png' 
     set log; replot 
*/ 
class BigIntegerBenchmarkGcd 
{ 
    // Simple alternative implementation of gcd. 
    // More than 10000 times faster than the builtin gcd for a=10^1000000-3, b=10^1000000. 
    private static java.math.BigInteger myGcd(java.math.BigInteger a, java.math.BigInteger b) 
    { 
     a = a.abs(); 
     b = b.abs(); 
     while (true) 
     { 
      if (b.signum() == 0) return a; 
      a = a.mod(b); 
      if (a.signum() == 0) return b; 
      b = b.mod(a); 
     } 
    } // myGcd 

    // Make sure myGcd(a,b) gives the same answer as a.gcd(b) for small values. 
    private static void myGcdConfidenceTest() 
    { 
     System.err.print("Running confidence test... "); 
     System.err.flush(); 
     for (int i = -10; i < 10; ++i) 
     for (int j = -10; j < 10; ++j) 
     { 
      java.math.BigInteger a = java.math.BigInteger.valueOf(i); 
      java.math.BigInteger b = java.math.BigInteger.valueOf(j); 
      java.math.BigInteger theirAnswer = a.gcd(b); 
      java.math.BigInteger myAnswer = myGcd(a, b); 
      if (!myAnswer.equals(theirAnswer)) { 
       throw new AssertionError("they say gcd("+a+","+b+") is "+theirAnswer+", I say it's "+myAnswer); 
      } 
     } 
     System.err.println("passed."); 
    } 

    public static void main(String args[]) 
    { 
     boolean useMine = false; 
     if (args.length==1 && args[0].equals("theirs")) 
      useMine = false; 
     else if (args.length==1 && args[0].equals("mine")) 
      useMine = true; 
     else 
     { 
      System.err.println("Usage: BigIntegerBenchmarkGcd theirs|mine"); 
      System.exit(1); 
     } 

     myGcdConfidenceTest(); 

     System.out.println("# numDigits seconds"); 
     for (int numDigits = 1; numDigits <= (1<<20); numDigits *= 2) 
     { 
      java.math.BigInteger b = java.math.BigInteger.TEN.pow(numDigits); 
      java.math.BigInteger a = b.subtract(java.math.BigInteger.valueOf(3)); 

      System.out.print(numDigits+" "); 
      System.out.flush(); 

      long t0nanos = System.nanoTime(); 
      java.math.BigInteger aInverse = useMine ? myGcd(a, b) 
                : a.gcd(b); 
      long t1nanos = System.nanoTime(); 

      double seconds = (t1nanos-t0nanos)/1e9; 
      System.out.println(String.format("%.9f", seconds)); 
     } 
    } // main 
} // class BigIntegerBenchmarkGcd 
+1

जावा स्रोत कोड आपके अवलोकन और विश्लेषण के लिए उपलब्ध है -

Btw, 10^n हमेशा coprime के लिए 10^n है। –

+0

[ओपनजेडीके कार्यान्वयन] (http://grepcode.com/file/repository.grepcode।com/java/root/jdk/openjdk/8u40-b25/जावा/गणित/BigInteger.java # BigInteger.gcd% 28java.math.BigInteger% 29), वैसे भी। – chrylis

+2

यदि आपके पास बेहतर कार्यान्वयन है, तो इसे सबमिट करें ताकि अगला जावा संस्करण इसका उपयोग कर सके, मान लीजिए कि यह सभी उपयोग-मामलों के बराबर है। – Andreas

उत्तर

0

BigInteger के लिए:

linear scale small linear scale large log scale

यहां कार्यक्रम सूची है a और b जिनकी बिट लंबाई 1 से अधिक नहीं है, a.gcd(b) उपयोग binary GCD algorithm जो ओ (एन) घटाव और बदलाव करता है (जहां एन पूर्णांक की बिट लंबाई है)। इसका रनटाइम कमजोर रूप से निर्भर करता है कि इनपुट पूर्णांक क्या हैं, उदाहरण के लिए, वे एक दूसरे के करीब कितने करीब हैं। आपके मामले में, बी-ए = 3, और पहले से ही यूक्लिडियन एल्गोरिदम b = b.mod(a) के कार्यान्वयन के पहले पुनरावृत्ति पर 3 है। इसलिए एल्गोरिदम के चरणों की संख्या पूर्णांक की लंबाई पर निर्भर नहीं होती है, और यह तुरंत निकलती है। BigInteger के लिए 3.

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