कैसे एक आर कोड है कि अपने स्थानीय चमकदार सर्वर में एक चमकदार एप्लिकेशन का उत्पादन सेवा करने के लिए

Question

मैं से (BatchQC package)

library(BatchQC) 
    nbatch <- 3 
    ncond <- 2 
    npercond <- 10 
    data.matrix <- rnaseq_sim(ngenes=50, nbatch=nbatch, ncond=ncond, npercond= 
     npercond, basemean=10000, ggstep=50, bbstep=2000, ccstep=800, 
    basedisp=100, bdispstep=-10, swvar=1000, seed=1234) 
batch <- rep(1:nbatch, each=ncond*npercond) 
condition <- rep(rep(1:ncond, each=npercond), nbatch) 
batchQC(data.matrix, batch=batch, condition=condition, 
     report_file="batchqc_report.html", report_dir=".", 
     report_option_binary="111111111", 
     view_report=FALSE, interactive=TRUE, batchqc_output=TRUE) 

निम्नलिखित आर कोड है जब RStudio कंसोल में चलाने के लिए, यह इस का उत्पादन:

मेरे सवाल यह है कि मैं अपने स्थानीय Shiny Server

0 के माध्यम से उस साइट दिखा सकते हैं

Answer 1

स्थानीय चमकदार सर्वर के साथ आपका क्या मतलब है? जब आप आर से पूर्वावलोकन चलाते हैं जो पहले से ही स्थानीय है। यह है कि अगर आप एक पूर्ण चमकदार सर्वर आपकी मशीन पर स्थापित करते हैं, सिर्फ नमूना-क्षुधा में एक फ़ोल्डर बनाने और फिर चमकदार सर्वर (आमतौर पर http://127.0.0.1:3838/sample-apps/youfolder/

Answer 2

मुझे लगता है कि BatchQC पैकेज से परिचित नहीं हूँ करने के लिए ब्राउज़र को है, लेकिन यह सोचते हैं this one on GitHub, मैं batchQC समारोह को देखा और इस कोड को देखा:

appDir <- system.file("shiny", "BatchQC", package = "BatchQC") 
    if (appDir == "") { 
     stop("Could not find shiny directory. Try re-installing BatchQC.", 
      call. = FALSE) 
    } 
    shiny::runApp(appDir, display.mode = "normal") 

तो, मैं अगर यह काम करते हैं या नहीं होगा (मैं पैकेज अपने आप को स्थापित करने में सक्षम नहीं था) पता नहीं है, लेकिन आप कोशिश कर सकते हैं निम्नलिखित लाइनों के साथ अपने चमकदार सर्वर में app.R फ़ाइल बनाने के लिए:

appDir <- system.file("shiny", "BatchQC", package = "BatchQC") 
shiny::runApp(appDir) 

गारंटी नहीं दे सकता कि यह काम करेगा, लेकिन इसे आजमाएं।