आर डुप्लीकेट पंक्तियों के संयोजन और नया स्तंभ डुप्लिकेट

Question

मैं एक डेटा फ्रेम है कि इस तरह दिखता है की आईडी युक्त जोड़ने:,

Chr start stop ref alt Hom/het ID 
chr1 5179574 5183384 ref Del Het 719 
chr1 5179574 5184738 ref Del Het 915 
chr1 5179574 5184738 ref Del Het 951 
chr1 5336806 5358384 ref Del Het 376 
chr1 5347979 5358384 ref Del Het 228 

मैं किसी भी डुप्लिकेट पंक्तियों को मर्ज करना चाहते हैं पिछले आईडी स्तंभ तो वह सब के संयोजन आईडी इस प्रकार, एक पंक्ति/स्तंभ में हैं: लोग डुप्लिकेट को दूर करने और एक स्तंभ संक्षेप की

Chr start stop ref alt Hom/het ID 
chr1 5179574 5183384 ref Del Het 719 
chr1 5179574 5184738 ref Del Het 915, 951 
chr1 5336806 5358384 ref Del Het 376 
chr1 5347979 5358384 ref Del Het 228 

मैं पाया है उदाहरण है, लेकिन मैं सिर्फ एक कॉलम में एक सूची में डुप्लिकेट क्षेत्रों के साथ सभी आईडी संयोजित करना चाहते हैं।

Answer 1

कुछ कॉल aggregate() को चाल करना चाहिए।

यहाँ एक विकल्प है कि पहचान पत्र एकत्र करता है एक सूची वस्तु में है:

df2 <- aggregate(df[7], df[-7], 
       FUN = function(X) paste(unique(X), collapse=", ")) 

दो विकल्पों में से परिणाम की तुलना:

(df1 <- aggregate(df[7], df[-7], unique)) 
# Chr start stop ref alt Hom.het  ID 
# 1 chr1 5179574 5183384 ref Del  Het  719 
# 2 chr1 5179574 5184738 ref Del  Het 915, 951 
# 3 chr1 5336806 5358384 ref Del  Het  376 
# 4 chr1 5347979 5358384 ref Del  Het  228 

और यहाँ एक है कि उन्हें एक चरित्र वेक्टर में जमा करता है

str(df1$ID) 
# List of 4 
# $ 0: int 719 
# $ 3: int [1:2] 915 951 
# $ 7: int 376 
# $ 8: int 228 

str(df2$ID) 
# chr [1:4] "719" "915, 951" "376" "228"