ggplot2 heatmap: लेबल ऑर्डर को कैसे सुरक्षित रखें?

Question

मैं इस समस्या

http://biostar.stackexchange.com/questions/921/how-to-draw-a-csv-data-file-as-a-heatmap-using-numpy-and-matplotlib

में casbon के समाधान निम्नलिखित csv डेटा का उपयोग कर ggplot2 में हीटमैप प्लॉट करने के लिए कोशिश कर रहा हूँ एक्स-लेबल फिर से तरह करने के लिए स्वयं की कोशिश है। उदाहरण के लिए, यदि मैं उस उदाहरण डेटा में लेबल COG0002 और COG0001 को स्वैप करता हूं, तो एक्स-लेबल अभी भी सॉर्ट ऑर्डर (cog0001, cog0002, cog0003 .... cog0008) में बाहर आ जाता है।

क्या इसे रोकने के लिए वैसे भी है? मैं चाहता हूँ करने के लिए इसे

धन्यवाद

पीपी

Answer 1

आप csv फ़ाइल से सीधे आदेश रखना चाहते हैं:

foomelt$COG <- factor(foomelt$COG, levels = as.character(foo[[1]])) 

Answer 2

आप की साजिश रचने से पहले कारक स्तरों को पुन: क्रम कोशिश की csv फ़ाइल में के रूप में आदेश दिया जा करने के लिए? उदा।

foomelt$COG = factor(foomelt$COG,levels(foomelt$COG)[c(2,1,3:8)]) 

(मैं अभी की कोशिश नहीं कर सकते, तो मुझे यकीन है कि यह काम करता है नहीं किया जा सकता)

Answer 3

यदि मुझे याद है, डिफ़ॉल्ट स्तर तर्क के साथ कारक (x) को कॉल करते समय, स्तर स्तर = क्रम (अद्वितीय (x)) के रूप में सेट होते हैं।

आप स्तर = अद्वितीय (x) सेट करके इस क्रिया को ओवरराइड कर सकते हैं।

उदाहरण के लिए:

set.seed(1) 
x = sample(letters, 100, replace = TRUE) 
head(x, 5) 

[1] "जी" "j" "ओ" "x" "f"

levels(factor(x)) 

[1] "एक" "बी" "ग "" डी "" ई "" एफ "" जी "" एच "" मैं "" जे "" के "" एल "" एम "" एन "" ओ "" पी "" क्यू "" आर "" एस "

[20] "टी" "यू" "वी" "डब्ल्यू" "x" "y" "z"

levels(factor(x, levels = unique(x))) 

[1] "जी" "जे" "ओ" "एक्स" "एफ" "वाई" "आर" "क्यू" "बी" "ई" "यू" "एम" "एस" "जे" "डी" "कश्मीर" "एक" "डब्ल्यू" "मैं"

[20] "पी" "वी" "सी" "n" "टी" "l" "h"

आप देख सकते हैं कि स्थापित करने का स्तर = अद्वितीय (एक्स) डेटा में घटना के क्रम को बरकरार रखता है।